Не совсем понятно, какая связь между заменой колеса и ухудшением тормозов? Тормоза то старые остались? Или речь идет о более тощей покрышке и уменьшении пятна контакта?

Недавно столкнулся с такой проблемой, в сервисе сказали что колодки изношенны на половину и надо только прокачать систему, так как мотоцикл долго стоял. Прокачали, но не помогло, возвращаться к ним не стал, надо было домой ехать, а уже в НН сам снял колодки и они оказались стертыми до металла!
Проверьте колодки в первую очередь.

Точно?

Стояло 16 колесо сток, поставил 21 фэт спок которое тяжелее в 3 раза.
Тормоза остались сток.

И колесо тяжелее, и пятно меньше, и, главное, полагаю - рычаг (радиус колеса) стал больше. Закономерно.

Тогда уж лучше более цепкий суппорт. Хотя с учетом уменьшения пятна может начать блокироваться со всеми вытекающими... Или диаметр тормозного диска увеличить, но опять же...

Можно попытаться поменять колодки на более мягкие, если не поможет можно попробовать поставить диск с другим рисунком или составом металла. Я тоже недавно поменял колесо на более тяжелое (1кг разница были спицы, поставил литье) разницы особой не заметил, хотя я передним тормозом почти не пользуюсь. Можно конечно и супорт много поршневой поставить.

А по колодкам что посоветуешь?

Меняй тормозной диск на увеличенный. А суппорт устанавливается через проставку.

Смотри на ебее эти диски. Стоковый размер 11,5, у увеличенных - 13.

какой тормозной суппорт сейчас стоИт?
есть возможность для установки второго диска?