Эта дыра как раз на стыке коробки и мотора, на фото хорошо видно. Герметичность она не нарушает
Скорей всего она сделана для того чтобы разжимать коробку и мотор при разборке.
А течь праймери обычно происходит по болтам крепления, читал много раз по форумам, народ жалуется. Даже новые из салона текут. Ну это больше знатоки твинкамов подскажут, или сам покопай.